• 课程安排

    推荐动植物研究者参加;适合零基础学员参加;通过五天的学习可以自行完成基因组拼接、注释和常见比较基因组学分析;有基础的学员可选择参加后三天课程

    课前预习

    提前预习基因课视频(www.genek.tv)、安装软件

    1. 视频课程:《生物信息入门之 Linux》

    2. 视频课程:《生物信息软件安装》

    3. 视频课程:《测序数据过滤和质控》

    4. 服务器安装:blast、fastp、Soapdenovo

    5. 个人电脑安装:Mega

    第一天

    Linux 基础

    1. 测序原理:illumina、PacBio、Nanopore

    2. 计算机基础:CPU、内存、硬盘、核、进程、线程、并行计算等

    3. Linux 常用命令

    4. 生物信息软件安装:手动安装、自动安装

    第二天

    任务实操

    1. 高级命令:grep、sort、awk、sed 等

    2. 任务练习:测序数据过滤和质控

    3. 任务练习:基因家族分析

    第三天

    基因组拼接

    1. 基因组Survey:基因组大小、杂合度、重复序列含量评估

    2. 拼接策略制定:二代、三代、Hi-C等

    3. 拼接原理

    4. 拼接软件:SOAPdenovo、canu、pilion 等

    第四天

    基因组注释

    1. 重复序列注释:RepeatMasker

    2. 基因结构注释:使用 BRAKER 训练参数模型

    2. 基因结构注释:使用 Maker 自动化注释

    3. 基因功能注释:eggnog-mapper 结合自主开发流程

    第五天

    比较基因组

    1. 基因家族鉴定:orthofinder、韦恩图

    2. 物种树构建

    3. 共线性分析:MCscanX、共线性图

    4. 基因家族分析:同源基因鉴定、进化树构建、进化树美化
    5. 正选择分析

  • 讲师介绍

    一线工程师、CNS一作授课

    基因课介绍

    成立于 2017年7月,专注于生物信息学培训。

    基因课网校:已完成 14 门视频课程的开发,累计学员 3000 余人。

    线下培训班:武汉、成都、西安、杭州、广州、北京等地举办快速入门班 11 期、周末成长班 2 期,累计培训学员 500 余人。

    主讲老师 张旭东

    曾任华大基因项目组组长、产品研发组组长。
    2014年合伙创办贝纳基因,担任CTO。
    2017年创办基因课,专注生物信息学培训。

    发表文章:麻疯树基因组计划(the plant journal)、鹰嘴豆基因组计划(Nature Biotechnology)、 芝麻基因组计划(Genome Biology)、猕猴桃群体研究(New Phytologist)。

  • 往期精彩

    学习知识 结交朋友

  • 报名流程

    1

    在线报名

    扫描下方二维码报名

    2

    电话沟通

    2小时内,我们会与您电话或微信沟通、解答疑问

    3

    缴费

    建议提前转账;如需现场刷卡需支付200元定金。

    4

    开通预习资料

    开通视频课程提前预习

    5

    参加培训

    请携带笔记本电脑参加

  • 报名

    提前报名,享受优惠,报名后会发送资料至邮箱

    或扫码微信咨询

  • 报名费用

    单期

    4500/人

    • 前10人优惠 500元
    • 老学员优惠 500元
    • 老学员推荐优惠100元
    • 3人组团,每人优惠300元;5人组团,每人优惠500元;
    • 以上优惠不可叠加。

    超级会员

    10900/人(原价14800/人)

    • 可参加1年内基因课独立举办的所有培训班
    • 承诺1年内举办培训班不少于 10 期
    • 邮递1年内内所有培训班教材
    • 有效期从参加第一期培训班开始计算
    • 仅限本人参加
  • 缴费方式

    方式一:银行对公转账

    户名:武汉简并科技有限公司
    开户银行:汉口银行股份有限公司光谷分行
    账 号:005041000451905

    方式二:支付宝对公转账

    用户名:武汉简并科技有限公司
    公司支付宝:service@genek.tv

    方式三:现场缴费

    支持现金、支付宝、微信、银行卡、公务卡等

    需提前支付200定金,预留名额